交通
鉄道
市の南部を西日本旅客鉄道(JR西日本)の幹線鉄道である草津線が東西に走る。草津線は、1889年に関西鉄道として三雲駅・草津駅 (滋賀県)/草津駅間が開通、翌1890年に三雲駅・柘植駅/上柘植駅間が開通し、1906年の鉄道国有法に基づき1908年国有化された。市内の駅は三雲駅、甲西駅、石部駅だが、このうち甲西駅は1981年の第36回国民体育大会/びわこ国体に合わせて設置された請願駅である。草津線は単線だが、三雲駅と石部駅には行き違い線がある。現在、甲西駅に行き違い線を設置することを「草津線複線化促進期成同盟会」(会長・嘉田由紀子県知事)で検討。行き違い線の整備を、複線化の前段階としている。
東海道新幹線の最寄駅は京都駅である。2012年には隣接の栗東市に(仮称)南びわ湖駅が開業する予定とされていた。しかし、2006年の県知事選挙で建設凍結派の嘉田由紀子が「もったいない。」を合言葉に当選。「東海道新幹線(仮称)南びわ湖駅設置促進協議会」での議論は、建設凍結に傾いた県側の意思決定能力不足で時間切れとなり、2007年10月31日をもって基本協定等が終了した。
バス
ファイル:Meguru-kun.jpg/thumb/240px/湖南市コミュニティバス
滋賀交通の乗合バスがJR野洲駅(野洲市)から湖南市北西部の菩提寺と北山台で折り返している。また、若干であるが、水口(甲賀市)方面へ行くバスもある。市の北部を通る名神高速道路菩提寺パーキングエリアに京都と名古屋を結ぶ高速バスが停車する。その他、湖南市が滋賀交通子会社の滋賀バスに運行委託した湖南市コミュニティバス(ふれあい号・めぐるくん)が走っている。過去には草津駅と水口を結ぶ、国鉄バスや滋賀交通バスが国道1号で運行されていた。
道路
市域には、北西部をかすめるように名神高速道路が走り、菩提寺パーキングエリアが設置されている。最寄のインターチェンジは竜王ICと栗東ICである。新名神高速道路(第二名神とも呼ぶ)のインターチェンジは、信楽ICが最寄。新名神は、部分開通(草津JCT - 亀山東JCT)だが、名古屋方面へのアクセスが向上する効果もみられる。
「地理」の項で触れたように、市域は南北の山系と東西に流れて市域を分断する野洲川により狭窄部を形成しており、市の南側を走る国道1号は片側1車線で歩道未整備区間も長く、1日28,000台という通過車両数はすでに飽和状態に達し、深夜帯以外はほぼ終日渋滞続きという状態であり、溢れ出した自動車は、旧東海道などの生活道路にまで流入して小学生の通学安全を脅かしている。その対策のため、バイパスや市道の整備が進められている。
現在、国道1号バイパスの栗東水口道路が野洲川右岸に建設中で、2007年3月には片側1車線での暫定供用が開始された。同時に県道野洲甲西線の改良も行われ、市北部における東西交通が改善された。また、2009年7月には、市南部を東西に走る広域農道と、県道長寿寺本堂線を結ぶ市道南部中央線が開通し、市南部においても東西の交通は改善されていった。
一方、南北の交通については、2004年9月に県道彦根八日市甲西線の野洲川架橋である新生橋が開通、2009年3月には県道竜王石部線の菩提寺地先のバイパスが開通し、渋滞に改善が見られた。老朽化した甲西橋が架け替えられ、また、石部大橋が開通し、バイパス機能の飛躍が期待される。
'''高速道路'''
* 名神高速道路
:栗東インターチェンジ(栗東市)
:竜王インターチェンジ(竜王町)
* 新名神高速道路
:信楽インターチェンジ(甲賀市信楽町)
'''一般国道'''
* 国道1号、国道1号バイパス(水口道路、栗東水口道路)
* 国道477号
'''都道府県道/県道'''(主要地方道)
*滋賀県道・三重県道4号草津伊賀線(三雲西交差点から草津市までは国道1号と重複)
*滋賀県道13号彦根八日市甲西線
*滋賀県道22号竜王石部線
*滋賀県道27号野洲甲西線
*滋賀県道53号牧甲西線
'''一般県道'''
*滋賀県道113号石部草津線
*滋賀県道118号石部停車場線
*滋賀県道119号長寿寺本堂線
*滋賀県道165号春日竜王線